品牌:Snap Gene | 软件名称:Snap Gene | 分子生物学软件 | 版本语言:英文版 |
软件类型:生命科学软件 | 版本号:7.0 | 系统平台要求:Windows 10及以上 macOS 10.14或更高 Ubuntu 20.04、CentOS 8 (2105)或RedHat 8.4 |
系统硬件要求:250M | 版权:正版 | 配套附件:软件序列号 |
技术支持:正版软件 | 版本类型:教育、 商业 | 中文名称:分子生物学软件 |
SnapGene 是一款强大的多功能的分子生物学工具,能够非常直观的注释分析和DNA图谱,用于创建和共享丰富的注释文件,帮助用户准确清晰地为分子生物学绘制相关图形,生物相关的用户不要错过!
SnapGene可帮助用户快速计划,可视化和记录您的日常分析生物学程序,并为大家提供更安全快速的方法,现在每个DNA构建体都可以用丰富的电子格式记录,它节省了大量的时间和金钱,并且方便使用者快速发现问题,制作更加优化的决策和方案,软件界面友好,使用简单,记录方便,是一个非常理想的工具。
特征
DNA可视化
查看DNA序列的多个视图
地图:自定义,酶位点,特征,引物,ORF,DNA颜色等的显示。地图可以是圆形或线性格式
序列:使用双链模式查看酶位点,具有翻译,引物和DNA颜色的特征。单链模式显示具有彩色特征的紧凑概览
酶:从一系列酶组中选择。剪切网站可以显示为数字或行,按名称或频率***
特征:按名称、位置、大小、颜色,方向性或类型对带注释的要素列表进行***。复选框在紧凑或完全展开的显示之间的切换。
引物:按名称、位置、大小、颜色、方向性或类型对带注释的要素列表进行***。复选框在紧凑或完全展开的显示之间的切换。
历史:查看DNA构建体的自动生成的图形历史记录。
大序列支持
查看:利用SnapGene的高效数据处理功能,扫描具有数千个带注释功能的大型DNA序列
搜索:使用MICA算法即时在染色体内找到序列
缩放:使用多功能控件调整缩放系数和显示区域
蛋白质可视化
查看蛋白质序列的多个视图
地图:自定义区域、站点、键和序列颜色的显示
系列:使用具有相关特征的1或3个字母的氨基酸代码查看蛋白质序列
属型:查看蛋白质的分子量,消光系数,等电点和氨基酸组成。可以对蛋白质的选定部分进行相同的分析
特征:按名字、位置、大小、颜色或类型对带注释的功能列表进行***。复选框在紧凑或完全展开的显示之间的切换
历史:查看自动生成的蛋白质序列图形历史记录。祖先蛋白质或DNA序列可以作为单独的文件再生
直观的序列编辑
轻松编辑DNA和蛋白质序列
标准编辑:进行插入、删除、替换和大小更改。复制并粘贴序列时,会自动传输功能
DNA结束:编辑线性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯
序列颜色编码
将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种颜色之一
给两条DNA链或蛋白质序列着色。颜色在Map和Sequence视图中都可见
特征注释
自动特征检测:使用SnapGene数据库查找DNA序列中的常见特征,您选择的其他功能可以添加到自定义数据库中
手动特征注释:选择DNA或蛋白质序列的一部分,并使用灵活的GenBank兼容空间注释特征
模拟
SnapGene提供优雅、信息丰富的窗口,用于模拟各种常见的克隆换个PCR方法
限制性站点指标:确认限制性网站适合克隆
独特性:以粗体显示限制性位点或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组
甲基化敏感性:限制性位点被Dam , Dcm或EcoKI甲基化阻断。SnapGene将自动用星号标记该站点
特殊性质:利用工具提示来避免有问题的限制网站
限制性克隆
可视化克隆过程的所有方面
如果您已经准备好了一个过程,那么模拟仅需几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷,则可以捕获并纠正错误。
聚合酶链反应
模拟标准PCR
使用您自己的引物,或要求SnapGene自动设计引物。产品文件在其历史记录上存储模板和引物。
重叠延伸PCR
通过重叠延伸PCR融合片段
至多组装八个碎片。选择要连接的片段及其方向,SnapGene将设计引物。
引物定向诱变
使用诱变隐去进行***诱变
选择诱变引物,然后按一个按钮以查看修饰的质粒。历史颜色突出了突变。
网关?克隆
模拟网关?BP克隆或LR克隆,或两者在同一时间
为了方便起见,提供了公共的供体向量和目的向量。选择要组装的片段,Snap Gene将设计引物。
Gibson组装
通过融合多达八个片段或通过将多达八个片段插入向量来模拟Gibson Assembly。Gibson Assembly是一种流行的无缝克隆方法。
选择要融合的片段及其方向,Snap Gene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。
IN-FUSION?克隆
通过将最多八个片段插入载体来模拟Clontech的In-Fusion克隆。融合克隆是创建无缝基因融合的一种非常通用的方法。
选择要融合的片段及其方向,Snap Gene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反方向PCR产生。
TA和GC克隆
通过TA或GC克隆捕获PCR产物
选择常规TA克隆或高校GC克隆
为了方便起见,通过了常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。
退火寡核苷酸
将两个寡核苷酸退火以形成双链产物
使用简单的控件添加突出端以进行限制性克隆。
避免错误
使用SnapGene确保所需的结构是正确的,并确认已获得所需的序列。
基因融合阅读框
确保构造中的翻特征在框架中。
链接的翻译
使用“序列”视图可以一目了然的查看两个已翻译的要素是否在框架中。如果这样,翻译将链接在同一行上。如果不是,则翻译在单独的行上。
与参考序列比对
使用功能强大的对齐工具检查实际结构是否与模拟结构匹配。
映射概述
查看比对序列与参考序列匹配的地方以及存在差异的概述。
序列详细信息
自动记录
SnapGene自动记录操作以创建图形历史记录,并将原型构造在最终文件中。
全面的“撤销”功能
撤销几何所有操作。
不要为尝试SnapGene文件而感到害羞—重复步骤很容易。
历史和原型
查看构造的图形历史记录
单击操作以突出显示亲本和产物序列的相关部分,或单击PCR引物名称以查看引物序列。
在历史树中单击一个原型,以重新生成该原型序列文件,包括其注释和克隆历史记录。
历史颜色
使用可选的历史记录颜色来标识序列的新更改
查看有关组装结构的详细信息,包括结扎的粘性末端。
拥有您的数据
SnapGene使您可以选择读取和共享文件,同时保持对数据的完全控制。
安全文件管理
将SnapGene文件保存在所需的位置。
使用计算机上熟悉的安全操作系统来存储和组织SnapGene文件,
从其他格式导入
读取许多常见的文件格式
不仅导入DNA序列,还导入注释。将继续开发进口商,以确保您不会被锁定为专有文件格式。
导出为标准格式
将序列,图谱或凝胶图像转换为标准格式。将地图或模拟的穷糖凝胶导出为常见的图像格式。
与SnapGene Viewer共享数据
只需将文件和链接发送到SnapGene Viewer。就像完善的SnapGene界面一样,收件人将能够看到图,序列和注释。
SnapGene 7.0引入了更新的外观和增强的数据管理功能。使用选项卡轻松导航文件和文件夹,并直接从新文件夹面板执行基于序列和元数据的文件搜索。其他增强功能包括新的引物插入注释和各种可用性改进。
选项卡式界面
使用新的选项卡式界面在文档之间导航,或将文档弹出到单独的窗口中以进行比较。
文件和文件夹管理
选择文件系统上的任意文件夹作为项目,并直接在新的可折叠文件夹面板中快速查看子文件夹和文件。执行标准文件运作并快速浏览所有支持的文件类型。
文件搜索
通过灵活、现代的界面,使用名称或类型、包含序列、特征注释等属性在项目中快速查找文件。
入门注释
在更新的添加/编辑引物对话框中可视化添加到引物的插入,例如酶、密码子或短肽序列。感兴趣的区域(Golden Gate限制位点、Gateway克隆attB位点、定向TOPO基序)现在也为自动设计的引物进行了注释。
预览检验到的新序列特征
新的文件窗格现在包含一个序列图,用于预览序列中检验到的特征,并允许您选择要包含在序列中的注释。
开始
使用新的“入门”窗格快速访问近来的文件和文件夹,或通过指向短视频教程、用户指南文章和SnapGene学院的链接了解有关如何使用 SnapGene 的更多信息。
系统操作要求:
Windows
SnapGene 5.1 - 6.0:Windows 7或更高版本(64位仅适用于Intel)。
SnapGene 6.1 - 7.0:Windows 10或更高版本(64位仅适用于Intel)。
基于ARM的计算机构建的Windows不支持SnapGene。
macOS
SnapGene 5.2.5或更早版本:macOS 10.12。
SnapGene 5.3 - 6.0:macOS 10.13或更高版本。
SnapGene 6.1 - 7.0:macOS 10.14或更高版本。
基于Apple ARM的计算机原生支持SnapGene 6.1版及更高版本。
Linux
SnapGene 4.0 - 5.2:Ubuntu 16.04、RedHat 6.6和7.2。
Snapgene 5.3 - 6.0:Ubuntu 18.04、CentOS 7 (1810)或RedHat 7.6。
SnapGene 6.1 - 7.0:Ubuntu 20.04、CentOS 8 (2105)或RedHat 8.4。
为基于ARM的计算机构建的Linux 不支持SnapGene。
硬件要求
内存 | 1GB以上 |
硬盘 | 250MB可用磁盘空间 |
显示 | 分辨率1440×900或更高分辨率 |
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